برگزاری دوره آموزشی فشرده شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم افزار لمپس (LAMMPS)
شرکت بنیان صنعت بَنوموسی به منظور افزایش سطح دانش و مهارت دانشجویان و محققان اقدام به برگزاری دوره آموزشی نرم افزار LAMMPS جهت شبیه سازی دینامیک مولکولی برای محققان فعال در علوم پایه و مهندسی نموده است.
سرفصل مطالب
- معرفی شبیه سازی مولکولی
- ایجاد ساختار اولیه
- آشنایی با میدان های نیرو و برهمکنش ها
- ارائه مثال های گوناگون
- بهینه سازی ساختار از لحاظ انرژی
- آنالیز و تفسیر نتایج خروجی
- آشنایی با نرم افزارهای جانبی مانند Avogadro ، VMD و Ovitto
- پردازش موازی روی سیستم های چندهسته ای
توضیحات
- زمان برگزاری: 24 و 25 بهمن ماه 98
- هزینه ثبت نام: 200 هزار تومان (20% تخفیف دانشجویی)
- مدت زمان دوره: 16 ساعت
- مدرس این دوره: دکتر محمد امین اسماعیل بیگ
- همراه با اعطای گواهی پایان دوره
- آنلاین و حضوری
- ظرفیت دوره: 20 نفر
همین الان ثبت نام کنید و اگر سوالی دارید با شماره 35424520-051 تماس بگیرید.
دینامیک مولکولی
دینامیک مولکولی یکی از شاخه های فیزیک محاسباتی است که برهم کنش میان اتم ها و مولکول ها را در بازه هایی از زمان بر اساس قوانین فیزیک، با استفاده از کامپیوتر شبیه سازی می کند. این روش برای اولین بار در سال ۱۹۵۷ توسط آلدر(Alder) و واینرایت(Wainwright) برمبنای مدل کره سخت به کار گرفته شد. در سال ۱۹۶۴ رحمان (Anees Rahman) مدل کره نرم را در شبیه‌سازی خود به کار برد. از وی به عنوان پدر دینامیک ملکولی یاد می‌شود.
دینامیک مولکولی شکلی از شبیه‌سازی کامپیوتری است که در آن اتم‌ها و مولکولها اجازه دارند برای یک دوره از زمان تحت قوانین شناخته شده فیزیک باهم برهم کنش کنند و چشم‌اندازی از حرکت اتم‌ها بدهند. از آنجائیکه سیستم‌های مولکولی عموماً شامل تعداد زیادی از ذرات هستند امکان‌پذیر نیست که ویژگی‌های سیستم‌های پیچیده را به‌طور تحلیلی بدست آوریم. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی این مسئله را با بکار بردن روش محاسباتی حل می‌کند. این روش یک واسطه بین تجربیات آزمایشگاهی و نظریه ایجاد می‌کند و به عنوان یک آزمایش مجازی در نظر گرفته می‌شود.
دینامیک مولکولی روابط بین ساختار مولکولها، حرکت مولکولها و توابع مولکولی را بررسی می‌کند. دینامیک مولکولی یک روش منظم چندگانه‌است. قوانین و نظریه‌های آن از ریاضیات، فیزیک و شیمی بدست می‌آید و الگوریتم‌هایی را از علم رایانه و نظریه اطلاعات بکار می‌برد. دینامیک مولکولی ابتدا در فیزیک نظری در دهه ۱۹۵۰ استفاده شد. اما امروزه بیشتر در علم مواد و زیست مولکول بکار می‌رود. قبل از اینکه امکان شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با رایانه‌ها به وجود بیاید عده‌ای کار سخت آزمایش کردن آن به وسیلهٔ مدل‌های فیزیکی مانند کره‌های ماکروسکوپیک را در دستورکار قرار دادند[منبع: ویکیپدیا].
نرم افزار لمپس
لمپس یک کد کلاسیک دینامیک مولکولی با تمرکز بر مدلسازی مواد و مصالح است. ایده و توسعه این نرم افزار توسط آزمایشگاه ساندیا آمریکا بوده است. این نرم افزار یک نرم افزار متن باز است که توانایی پردازش موازی را هم دارد. کاربرد آن در مدل سازی اتمی، پلیمری، بیولوژیکی، فلزی، گرانول، و سیستم های دانه درشت است. همچنین دارای انواع پتانسیل های برهمکنش ذرات است. به طور کلی با این نرم افزار می توان مواد را در مقیاس های مختلف مدل کرد. نرم افزار در سیستم عامل های ویندوز، لینوکس و مک قابل استفاده است. مولفان و کلیه کسانی که در توسعه این نرم افزار کمک کرده اند در اینجا آورده شده است. فیلم ها و عکسهای مطرحی که از این نرم افزار در مراجع بین المللی بدست آورده شده است در اینجا موجود و در معرض نمایش است.
دانلود
آخرین نسخه LAMMPS را می توانید از اینجا دانلود کنید و حتی ورژن های قبل تر آن همواره برای دانلود در دسترس است.